В целях повышения эффективности научно-исследовательских работ, концентрации усилий коллектива университета на решении важнейших задач научно-технического обеспечения агропромышленного комплекса в 2008 году было организовано управление организации научных исследований и подготовки научно-педагогических кадров, которое в связи с изменениями в структуре университета с 1 августа 2019 года было реорганизовано в Отдел научно-организационной работы и аспирантуры.
Научные исследования проводятся по тематическому плану научно-исследовательских работ на всех факультетах университета и в Институте экономики и управления в АПК по кафедральным темам, финансирование которых проводится за счет бюджетного финансирования основной деятельности вуза и договорам с различными министерствами, ведомствами и предприятиями. В исследованиях принимают участие доктора и кандидаты наук, докторанты, аспиранты и студенты.
Проведение фундаментальных и прикладных исследований по государственным программам и заказам в области сельского хозяйства
Участие в разработке важнейших научных проблем, связанных с развитием и совершенствованием высшего заочного образования в РФ
Содействие подготовке научных кадров и повышению научной квалификации профессорско-преподавательского состава и сотрудников научных подразделений
Внедрение результатов научных исследований и разработок в отраслях АПК